El programa de posgrado en Inmunología fue fundado en enero de 1967, con la participación de los investigadores Dr. Carlos Biro, Dr. Félix Córdoba y Dr. Jesús Kumate, adscritos a instituciones externas al IPN, y del Dr. Sergio Estrada Parra, profesor de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas.
Se inició con un programa teórico y práctico, en el cual los alumnos concurrían a laboratorios y a un Seminario fuera de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, con la asistencia de los miembros fundadores y otros investigadores. El fuerte apoyo de la comunidad científica mexicana consolidó a este primer Posgrado en Inmunología de toda Latinoamérica. Evidencia de lo anterior son los más de 120 doctores, más de 270 maestros en ciencias y numerosos especialistas en Inmunología que han egresado del programa desde su fundación. La diáspora de inmunólogos egresados de nuestra institución se extiende a reconocidas universidades, instituciones científicas independientes, centros hospitalarios, entidades gubernamentales y empresas, en la Ciudad de México, en los Estados de la República Mexicana y en el extranjero. Durante los cuarenta y dos años transcurridos desde su fundación, el programa de estudios permanece en constante actualización en respuesta al avance explosivo de la ciencia. Asimismo, los investigadores realizan proyectos de vanguardia, apoyados por presupuesto del I.P.N. y de diversas instituciones nacionales y extranjeras. Adicionalmente, la infraestructura de equipamiento y su acervo bibliográfico garantizan la factibilidad de los proyectos en los que se involucra a los estudiantes para la realización de sus tesis de grado.
Formar individuos con valores éticos, con alto nivel académico, que realicen investigación en el área de la Inmunología para generar conociminientos y aportar a la solución de problemas de los sectores social y de salud, y que participen en la enseńanza de la inmunología a nivel de licenciatura y de posgrado.
El programa de Maestría en Ciencias en Inmunología es líder a nivel nacional e internacional en la formación de recursos humanos del más alto nivel de especialización, que genera conocimientos en la especialidad a través de sus líneas de investigación, a través de las cuales además mantiene colaboraciones con Universidades, Institutos y Centros de Investigación en el territorio mexicano y en el extranjero, fortaleciendo al Instituto Politécnico Nacional, y con los que se apoya al desarrollo del país, formando egresados encaminados a resolver problemas de los sectores social, de salud e industrial.
El Programa de Maestría en Ciencias en Inmunología tiene como objetivo formar recursos humanos con valores éticos, con aptitudes para el desarrollo de la ciencia, con vocación en la investigación y con visión para el desarrollo de productos y aplicaciones con ideas innovadoras y creativas, que aporten al conocimiento universal o coadyuven a la resolución de problemas de los diferentes sectores de la sociedad.